Das House of Finance wird von einem Geschäftsführenden Direktor geführt, der den Präsidenten der Goethe-Universität Frankfurt am Main in seiner Funktion als Hausherrn vertritt. Dem Geschäftsführenden Direktor steht ein Präsidium zur Seite, das aus den Leitern der im House of Finance untergebrachten universitären Abteilungen besteht. Der Geschäftsführende Direktor und das Präsidium unterstützen den Präsidenten bei der Entscheidungsfindung und koordinieren eigene Initiativen des House of Finance. Das Kuratorium hat beratende Funktion.