Das House of Finance kooperiert als Gesamtheit sowie über die im Haus tätigen Einrichtungen auf nationaler und internationaler Ebene mit einer Vielzahl von Institutionen. Die Zusammenarbeit erstreckt sich auf Zentralbanken und Regulierungsbehörden sowie inhaltlich verwandte Forschungs- und Transfereinrichtungen und akademische Partnerschaften.

Als eines der vom Land Hessen initiierten „Houses of“ besteht eine enge Verbindung zu den vier Schwestereinrichtungen, insbesondere zum House of Digital Transformation (HoDT) und dem House of Pharma and Healthcare (HoPH); mit beiden Einrichtungen gibt es gemeinsame Weiterbildungsstudiengänge der Goethe Business School. 

Unter dem Dach des House of Finance vereinen sich wissenschaftliche Kooperationen und Beratungsaktivitäten mit Einrichtungen des Bundes, beispielsweise mit dem Forschungsdatenzentrum der Bundesbank, dem Forschungsdatenzentrum der Statistischen Ämter des Bundes und der Länder oder der Bundesanstalt für Finanzdienstleistungsaufsicht (BaFin).

Durch das neu gegründete Competence and Transfer Center „Sustainable Finance and Regulation“ (CTC) koordiniert das House of Finance zudem ein interdisziplinäres Netzwerk überwiegend regionaler akademischer Partner. Dieses Forschungsnetzwerk findet seinen Ursprung in einem 2022 unterzeichneten „Memorandum of Understanding“ zwischen der Goethe Universität und mit dem in Frankfurt angesiedelten und für Europa und Afrika zuständigen Büro des International Sustainability Standards Board (ISSB) sowie weiteren assoziierten Partnern. Die Kooperationsvereinbarung spiegelt die Stärke des Forschungsstandorts Frankfurt am Main wider, der geprägt ist von ökonomischer-, finanzwissenschaftlicher, aber auch naturwissenschaftlicher Expertise. Um die Reichweite des Nachhaltigkeitsnetzwerks rund um das CTC zu stärken, ist das House of Finance seit 2025 auch Mitglied im Sustainable Finance Cluster (SFC) Frankfurt am Main. 

Das House of Finance kooperiert zudem mit den beiden gemeinnützigen, der Förderung von Forschung und Wissenstransfer dienenden und in Frankfurt am Main ansässigen Instituten Frankfurt Institute of Risk Management (FIRM) sowie dem Institut für Bank- und Finanzgeschichte (IBF).

Auch international pflegt das House of Finance gemeinsame Forschungsprojekte und fachlichen Austausch unter anderem mit der Europäischen Zentralbank, der European Insurance and Occupational Pensions Authority (EIOPA), und dem International Sustainability Standards Board (ISSB).

Eine langjährige akademische Partnerschaft besteht mit der Wharton School der University of Pennsylvania, mit der das House of Finance im Rahmen der Christoph von Metzler Stiftungsgastprofessur für internationale Finanzwirtschaft ein Austauschprogramm mit jährlich wechselnden Gastprofessuren pflegt. Ein weiterer akademischer Partner des House of Finance ist das Paris House of Finance, das seinen Sitz an der Université Paris-Dauphine PSL hat.

Im Bereich der Graduierten- und Doktorandenausbildung ist das House of Finance über mehrere bilateralen Partnerschaften mit renommierten europäischen Universitäten verbunden, darunter Mitglieder des Quantitative Techniques for Economics and Management (QTEM)-Netzwerks, wie die LUISS Universität in Rom und die Solvay Brussels School of Economics and Management.  Weitere globale Kooperationen bestehen mit dem Center for Advanced Research (CARF) der Universität Tokio und dem Nordic Finance Network (NFN) in Skandinavien. 

Über das House of Finance ist die Goethe-Universität ferner Mitglied der Global Research Alliance For Sustainable Finance and Investments (GRASFI), eines Netzwerks forschungsstarker akademischer Einrichtun gen wie unter anderem der University of Oxford, der London School of Economics and Political Science (LSE) oder der Université Paris-Dauphine. 

Im Center for European Policy Research (CEPR) haben Forscherinnen und Forscher aus dem House of Finance zurzeit zwei wichtige Funktionen inne: Nicola Fuchs-Schündeln ist Programmdirektorin für den Bereich "Macroeconomics and Growth" und Michalis Haliassos leitet das Forschungsnetzwerk für das Feld "Household Finance".